Сериал «Ночной агент» закручивается вокруг одного телефонного звонка. Обычный дежурный в ФБР Питер Сазерленд слышит в трубке испуганный голос девушки, которая утверждает, что за ней охотятся. Этот звонок вмиг превращает его тихую ночь в кошмар.

Вместо того чтобы просто принять вызов, Питер бросается на помощь Роуз Ларкин. Но спасение одной женщины оказывается лишь первым шагом в смертельно опасной игре. Он быстро понимает, что наткнулся не на частную угрозу, а на нити чего-то огромного и тщательно скрытого.

Теперь ему приходится бежать и разгадывать головоломку, не зная, кому можно доверять. Каждое действие приближает его к разгадке, но одновременно делает мишенью для могущественных врагов. Это история не о супергерое, а о человеке, который по долгу службы оказался единственным, кто может остановить заговор, способный перевернуть всё с ног на голову.